In Eden geht es um einen tödlichen Virus der die Erde heimsucht und einen großen Teil der Menschheit ausrottet. Zwei Kinder,ein Junge und ein Mädchen,leben mit ihrem Pflegevater auf einer Insel,der Mann stirbt auch an dem Virus,doch die Kinder scheinen nun immun zu sein und Antikörper zu besitzen. Der Junge reaktiviert einen Kampfroboter und Helikopter kommen auf die Insel um die Kinder mitzunehmen. Doch es gelingt den Kindern auf der Insel zu bleiben,denn der Kampfroboter tötet alle. 20 Jahre später zieht ein Junge mit dem selben Roboter durch die Gegend und wird eines Tags angegriffen,womit ein neues Abenteuer beginnt ...