Unter der Schule entdeckt ein Oberstufen Schüler namens Makoto Mizuhara eine Anitike Grabkammer. Als er eines Nachts von Jinnai gejagt wird,passiert etwas mysteriöses : Die Zeit scheint stehen geblieben zu sein und nur noch Makoto kann sich noch bewegen und gelangt in die vor kurzem entdeckte Grabkammer,wo ein ihm sehr bekanntes Mädchen erscheint. Makoto und auch seltsamerweise ein paar andere aus seiner Schule gelangen in eine fremde Welt, „El Hazard“,wo Makoto als Retter begrüßt wird und ihm offenbart wird,dass er einen bevorstehenden Krieg verhindern soll.